Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRIP1Q5VSL9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRIP1Q5VSL9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRIP1Q5VSL9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms