Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH2D4BQ5SQS7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4BQ5SQS7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2D4BQ5SQS7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms