Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAT1Q5SQI0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATAT1Q5SQI0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms