Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSL3PQ5NE16 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSL3PQ5NE16 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSL3PQ5NE16 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms