Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB41Q5JT25 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB41Q5JT25 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB41Q5JT25 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms