Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM47AQ5JRC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM47AQ5JRC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms