Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CT47A1Q5JQC4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CT47A1Q5JQC4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CT47A1Q5JQC4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms