Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KHDC3LQ587J8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KHDC3LQ587J8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KHDC3LQ587J8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms