Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGO2Q562F6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGO2Q562F6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SGO2Q562F6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGO2Q562F6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms