Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TBRG1Q3YBR2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBRG1Q3YBR2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms