Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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