Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GRAMD1BQ3KR37 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRAMD1BQ3KR37 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRAMD1BQ3KR37 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms