Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCGF3Q3KNV8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCGF3Q3KNV8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms