Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPRED3Q2MJR0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPRED3Q2MJR0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPRED3Q2MJR0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms