Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA9Q16795 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA9Q16795 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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