Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBE2SQ16763 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2SQ16763 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2SQ16763 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms