Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ECM1Q16610 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ECM1Q16610 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM1Q16610 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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