Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYPL1Q16563 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYPL1Q16563 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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