Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD2Q16342 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCD2Q16342 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD2Q16342 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms