Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTX1Q15818 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTX1Q15818 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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