Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALX1Q15699 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALX1Q15699 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ALX1Q15699 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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