Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALX1Q15699 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALX1Q15699 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ALX1Q15699 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALX1Q15699 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALX1Q15699 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALX1Q15699 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ALX1Q15699 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ALX1Q15699 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALX1Q15699 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ALX1Q15699 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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