Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP10Q15642 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP10Q15642 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms