Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRADDQ15628 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRADDQ15628 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRADDQ15628 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms