Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SURF1Q15526 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SURF1Q15526 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SURF1Q15526 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF1Q15526 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF1Q15526 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF1Q15526 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SURF1Q15526 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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