Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC23AQ15436 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC23AQ15436 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC23AQ15436 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
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