Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRKQ15262 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTPRKQ15262 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRKQ15262 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRKQ15262 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRKQ15262 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
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