Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD1Q15139 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD1Q15139 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD1Q15139 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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