Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCF4Q15080 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCF4Q15080 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCF4Q15080 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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