Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB3GAP1Q15042 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB3GAP1Q15042 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB3GAP1Q15042 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms