Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSME4Q14997 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME4Q14997 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME4Q14997 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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