Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB39AQ14964 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RAB39AQ14964 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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RAB39AQ14964 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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RAB39AQ14964 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39AQ14964 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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