Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSPNQ14714 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSPNQ14714 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSPNQ14714 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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