Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3AQ14563 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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