Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERV3-1Q14264 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERV3-1Q14264 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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