Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB33AQ14088 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB33AQ14088 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB33AQ14088 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB33AQ14088 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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