Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTMR1Q13613 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTMR1Q13613 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTMR1Q13613 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTMR1Q13613 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR1Q13613 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
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