Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX1Q13596 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX1Q13596 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX1Q13596 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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