Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRPF4BQ13523 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF4BQ13523 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF4BQ13523 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms