Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BFSP2Q13515 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BFSP2Q13515 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BFSP2Q13515 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms