Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XRCC4Q13426 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XRCC4Q13426 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC4Q13426 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms