Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTA1Q13330 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA1Q13330 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA1Q13330 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms