Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR5A1Q13285 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR5A1Q13285 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR5A1Q13285 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR5A1Q13285 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms