Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGDRQ13258 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTGDRQ13258 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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