Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RLFQ13129 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RLFQ13129 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RLFQ13129 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RLFQ13129 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RLFQ13129 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RLFQ13129 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RLFQ13129 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLFQ13129 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLFQ13129 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLFQ13129 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLFQ13129 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RLFQ13129 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLFQ13129 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLFQ13129 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLFQ13129 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLFQ13129 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLFQ13129 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RLFQ13129 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLFQ13129 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLFQ13129 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLFQ13129 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLFQ13129 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RLFQ13129 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RLFQ13129 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RLFQ13129 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RLFQ13129 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RLFQ13129 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RLFQ13129 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RLFQ13129 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLFQ13129 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLFQ13129 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RLFQ13129 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RLFQ13129 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLFQ13129 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLFQ13129 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLFQ13129 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLFQ13129 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLFQ13129 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLFQ13129 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RLFQ13129 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLFQ13129 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLFQ13129 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLFQ13129 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLFQ13129 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLFQ13129 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RLFQ13129 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RLFQ13129 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLFQ13129 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLFQ13129 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RLFQ13129 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLFQ13129 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RLFQ13129 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLFQ13129 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RLFQ13129 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLFQ13129 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLFQ13129 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLFQ13129 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLFQ13129 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLFQ13129 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RLFQ13129 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RLFQ13129 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLFQ13129 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RLFQ13129 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RLFQ13129 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RLFQ13129 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RLFQ13129 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RLFQ13129 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RLFQ13129 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RLFQ13129 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLFQ13129 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLFQ13129 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLFQ13129 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RLFQ13129 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RLFQ13129 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLFQ13129 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLFQ13129 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLFQ13129 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLFQ13129 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLFQ13129 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLFQ13129 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RLFQ13129 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLFQ13129 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLFQ13129 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLFQ13129 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLFQ13129 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLFQ13129 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLFQ13129 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLFQ13129 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RLFQ13129 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
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