Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT88Q13099 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT88Q13099 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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