Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ECH1Q13011 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECH1Q13011 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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