Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIK3Q13003 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK3Q13003 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK3Q13003 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
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