Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTP4A2Q12974 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTP4A2Q12974 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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