Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAPQ12770 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAPQ12770 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPQ12770 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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