Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCBP1Q09161 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCBP1Q09161 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NCBP1Q09161 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms